Equipe Statistique & Génome / Statistic & Genome team

L'équipe Statistique et génome crée et développe des méthodes statistiques originales, principalement orientées vers les technologies à haut débit issues de la biologie moléculaire.

The Statistique et génome team creates and develops original statistical methods, mainly oriented towards high-throughput technology used in molecular biology.

• Modèles Markoviens / Markovian models,
• Modèles de mélange et modèles à structures cachées / Mixture and latent variable models,
• Segmentation et détection de rupture / Segmentation and breakpoint detection,
• Tests multiples / Multiple testing,
• Compression et réduction de dimension / Compression and dimension reduction,
• Sélection de modèle / Model selection.

• Analyse des séquences biologiques / Biological sequence analysis:
  • Recherche de motifs / Motif detection,
  • Génomique comparative / Comparative genomics
• Analyse des données issues des différentes technologies de biopuces / Microarray data analysis:
  • Normalisation / Normalisation,
  • Transcriptome / Transcriptome,
  • Microarrays CGH (Comparative Genomic Hybridization) / CGH arrays,
  • « ChIP on chip ».
• Réseaux d’interaction biologiques / Biological interaction networks,
• Métagénomique / Metagenomics.

Caroline Berard Analyse statistique et bioinformatique des données ChIP-chip et transcriptomes tiling-array

Antoine Channarond
Alice Cleynen Analyse de données NGS
Jean-Benoist Leger Modélisation de la topologie d'un réseau d'interactions d'hôte-parasite par des graphes aléatoires hétérogènes
Stevenn Volant Modèles statistiques pour l'analyse de données transcriptome d'origine tilling-array